Гипоталамус влияет на все вегетативно-висцеральные функции организма, участвует в регуляции сна, бодрствования, эмоций, температуры тела, трофики тканей, дыхательной и сердечно-сосудистой систем, ЖКТ, обмена веществ, половой функции и эндокринных желез. Особо важна функция нейрокринии