Metagenomika mikroblar va ularning genetik materiallarini o'rganish bilan bog'liq ilmiy soha. Mikrobiomlarning xilma-xilligi va ekotizimdagi rolini aniqlashga yordam beradi. Yuqori o'tkazuvchanlikka ega sekvenslash texnologiyalari yordamida amalga oshiriladi