Бунисбатанмустақил тизим, асосан ички аъзолар ва ички муҳитни бошқаради. Бу тизим кўпинча автоматик равишда ишлайди, яъни бизларнинг идрокимизга бўйсинмайди, лекин бу бўйсинмаслик нисбий