Muhofaza etiladigan tabiiy hududlarning ekologik vazifasi biologik xilma-xillikni saqlash, ekotizimlarni barqarorlashtirish va tabiiy resurslarni muhofaza qilishdan iborat. Ular genetik fondni asraydi, iqlim o'zgarishiga qarshi kurashadi, suv resurslarini himoya qiladi va tuproq eroziyasini kamaytiradi