Qashqadaryo viloyatining tuproq turlari geografik joylashuviga qarab o'zgaradi. Tog' va tog' oldi hududlarida qo'rg'oshinli tuproqlar, tekisliklar va vodiylarda esa sho'rlangan tuproqlar ustunlik qiladi. Tog'li hududlarda qora, qo'ng'ir-yorqin va o'rmona tuproqlar tarqalgan