Mustaqillik davrida Qoraqalpog‘iston iqtisodiyoti sezilarli o‘zgarishlarga duch keldi. Hududda qishloq xo‘jaligi va sanoat asosiy tarmoqlar hisoblanadi. Paxta, bug‘doy, guruch yetishtiriladi. Sanoat tarmog‘ida ham o‘sish kuzatildi. Kichik va o‘rta biznes subyektlarining soni ortib bormoqda