Avtonom nerv sistemasi organizmning ichki muhitini saqlash, gomeostazni ta'minlash uchun muhim rol o'ynaydi. Bu tizim organlarning funksiyalarini tartibga soladi va avtonom reflekslar yordamida ichki organlarga ta'sir ko'rsatadi. Asetilxolin va adrenerjik retseptorlar ayrim muhim neyrotransmitterlar hisoblanadi va bu retseptorlar arqonlar orqali organlarning faolligini boshqarishda ishtirok etadi. Enterik nerv sistemasi ichak fiziologik jarayonlarini nazorat qiladi va parasimpatik nerv sistemasi "dam olish va hazm qilish" holatini ta'minlaydi, simpatik nerv sistemasi esa "kurash yoki qochish" reaktsiyasini faollashtiradi.