Harbiy epidemiologiya fani qo'shinlarni epidemiyalardan himoya qilishning nazariy va amaliy jihatlarini o'rganadi. U epidemiyaga qarshi profilaktik tadbirlarni ishlab chiqish va ularni o'tkazish qonun-qoidalarini o'rgatadi. Shuningdek, dushman tomonidan qo'llanilishi mumkin bo'lgan bakteriologik qurollar va ulardan harbiy xizmatchilarni saqlash usullarini ham o'rganadi